Сезон 2

Комиссар Гордон арестован: кто-то ловко сфабриковал доказательства получения им взяток от Руперта Торна. Обязанности комиссара временно исполняет его молодой помощник Гил Мейсон, на счету у которого несколько громких арестов. Пока Бэтмен, изображая гангстера Мэтчса Мэлоуна, пытается выяснить, кто подставил Гордона, дочь комиссара Барбара решает провести собственное расследование.

Бэтгёрл и Робин следуют за Гилом Мейсоном до места, где ему назначил встречу Двуликий. «Мэтчсу» удаётся освободиться, но у экс-прокурора имеется большой запас взрывчатки, и вскоре героической троице приходится бороться за свои жизни в затопленном метро.

Глиноликий возвращается в Готэм, но на этот раз он разваливается на части — в буквальном смысле. Чтобы найти его и помогающую ему загадочную женщину, Бэтмену приходится искать разгадку в «прошлой жизни» Мэтта Хейгена.

Вернувшись из поездки в Центральную Америку, Вероника Вриланд раздаёт всем своим знакомым маленькие фигурки — человечков, которые якобы забирают у владельца все его проблемы. Вскоре одарённые начинают один за другим лишаться больших денежных сумм и драгоценностей, почти добровольно отдавая их злоумышленникам в костюмах индейцев Майя.

Когда жизнь мафиозного босса Руперта Торна оказывается под угрозой, он просит сделать операцию своего старшего брата — когда-то уважаемого доктора Мэтта Торна, ныне вынужденного довольствоваться исключительно криминальными заказами. Но для того, чтобы провести операцию успешно, Мэтту необходима помощь его друга и коллеги — доктора Лесли Томпкинс.

После выхода из тюрьмы Памела Айсли вышла замуж за лечившего её врача и стала заботиться о его детях. Однако, богатые граждане Готэма лишаются своих средств способами, отражающими преступный почерк Ядовитого Плюща.

Сбежав из перевозившего его тюремного поезда, Убийца Крок проносится через лес и вскоре оказывается на расположенной в глуши общине, где живут бывшие актёры из «шоу уродов», решившие спрятаться подальше от обычных людей. Кроку удаётся убедить их помочь ему в борьбе с Бэтменом.

Ра’с аль Гул похищает древнеегипетский свиток, который Брюс Уэйн передал готэмскому музею. Согласно легенде, манускрипт скрывает тайны жизни и смерти, и Демон рассчитывает получить с его помощью желаемую власть. Для того чтобы остановить бессмертного злодея, Бэтмен вынужден обратиться к его дочери…

Новый прокурор Готэма Джанет Ван Дорн заявляет о том, что пришло время судить Бэтмена как за его поступки, так и за то, что именно он создал многих преступников. Узнав об этом, заключённые Аркхэма захватывают в нём власть и похищают Бэтмена и прокурора для проведения суда под председательством Джокера. Ван Дорн приходится выступить в качестве адвоката Тёмного Рыцаря и убедить присяжных, которыми являются самые отпетые злодеи, в его невиновности.

Джокер похищает атомную бомбу, и Бэтмен с Робином должны остановить его. Не имея времени, им приходится обратиться за помощью к сидящей в Аркхэме Харли Квинн.