Сезон 2

Фмекки крадут человеческие обличия у своих противников, Аркиллианцев. Джея уменьшают до крошечных размеров, чтобы он выяснил, чего хотят добиться Фмекки.

Агент Джей работает круглыми сутками. Он хочет немного отдохнуть. Когда он замечает кратковременного клона Эл, он просит Эл сделать для него такого же. Эл сначала отказывает ему, но потом соглашается сделать троих — и только троих. Новейшая схема Альфы — использовать своего собственного клона Джея, дабы украсть мозг Зеда — спутывает все дела.

Альфа вернулся, и его инопланетные имплантаты разваливаются. Для начала он заставляет Джибса найти новые части тела для него, но когда он обнаруживает, что симбионт Трой находится у ЛВЧ, его планы меняются.

Дрекк, старый друг мопса Фрэнка, сбегает из-под стражи на Земле. Фрэнку грозит быть сваренным заживо, если он поможет Джею и Кею арестовать Дрекка.

Королева Жуков объявляет вознаграждение за поимку агента ЛВЧ, ответственного за убийство её любимого погибшего сына Эдгара. Теперь Эл должна скрываться от нескольких злых Жуков — включая брата Эдгара, Эдвина — желающих получить награду.

Настал Хэллоуин, и выпрашивать сладости вместе с Червями становится опасным — Джей встречает пришельца, который похищает детей.

Пришелец с разрушительным голосом по имени Алдузи сбегает от Эйлин и её новой напарницы, Иди. Чтобы проследить беглеца, Кей объединяется с Эйлин, а Джей — с Иди.

Паразиты, распространяемые из инопланетных семян, захватывают ЛВЧ и угрожают распространиться по всему миру. Пока оставшиеся агенты пытаются их остановить, Джей не может держать язык за зубами, так как он случайно оказался под воздействием сыворотки правды.

Готовясь завоевать землю, Фмекки врываются в штаб-квартиру ЛВЧ, чтобы наложить свои крошечные лапки на формулу роста. Они обознались, приняв одного из Червей за обладателя этой формулы, и похищают его…

Только Люди в чёрном могут спасти Рождество, когда Дрекк похищает Санта Клауса.

Усилитель Томазитронной Материи дарует супер-силы Кею, Джею и Эл, а также троице инопланетных преступников, что приводит к супер-драке.

Кей и Джей едут в Голливуд, чтобы расследовать исчезновения актёров-пришельцев.

Альфа и Дак, брат Джибса, захватывают военный спутник ЛВЧ. Джей и Кей вылетают в космос, чтобы остановить уничтожение штаб-квартиры ЛВЧ.