Сезон 1

Когда в закрытой комнате без окон убивают подозреваемого в нескольких преступлениях, для расследования этого дела правительство привлекает команду подопечных доктора Розена, обладающих необычайно развитыми способностями. Невероятная сила, дар убеждения, слуховая и зрительная синестезия, а также умение улавливать электромагнитные волны делает этих людей уникальными, а иногда и незаменимыми в расследовании аналогичных дел. Однако эти же способности мешают им самим приспособиться к реальности, в чем своим подопечным и старается помочь Ли Розен.

Из-за опасений повторного нападения на доктора Розена команда переезжает в другой район. Между тем Ли вызывают на место автоаварии, в ходе которой на воле оказался перевозимый пациент Маркус Эйерс, являющийся старым падопечным доктора и умеющий создавать продуманные цепочки событий. Маркус оставляет для Ли послание, заставляя того лично взяться за дело по его поиску, однако при встрече с Эйерсом Розен начинает подозревать, что тот сам является жертвой, а не только преступником.

Команда Альфа начинает расследование массовой потери самоконтроля в вагоне метро, закончившейся беспорядками и смертью нескольких пассажиров. При обследовании вагона Рэйчел обнаруживает, что находившиеся в нем люди были подвержены воздействию феромона, который распространила неизвестная. Пытаясь выследить девушку, Розен и его группа обнаруживают брата беглянки, который оказывается не так прост, как кажется поначалу. Между тем Кэмерон пытается свыкнуться со своим положением в команде, Пирзэд подвергается атаке со стороны родственников, а Гари протестует против шума в новом офисе.

Пытаясь захватить двух участников движения «Красный флаг», команда Альфа вместе с полицией получают не только в спешке оставленные документы и файлы, но и девушку-аутиста Анну, наладить связь с которой удается только Гари. Распознав ее стиль общения доктор Розен узнает, что та способна понимать все языки мира и может перевезти зашифрованные сообщения преступников. Благодаря одной из этих шифровок команде становится известно о планах экстремистов, а тем временем Белл раскрывает еще одну тайну найденной девушки.

Команда Альфа приезжает в штат Пенсильвания для расследования серии внезапных смертей непонятной аномалии. Внимание доктора привлекает выделяющаяся на фоне остальных гибель подростка в автоаварии, когда как остальные, взрослые жертвы, скончались от непонятной хвори. Несмотря на кажущуюся естественность гибели юноши команда решает в первую очередь проверить связь между происшествиями, а в это время еще один житель города погибает от той же болезни. Навестив мать погибшего школьника, Рэйчел проникается к ней сочувствием, а тем временем установленная остальными членами команды связь между погибшими людьми выводит их на возможного подозреваемого.

Для того, чтобы реабилитироваться после проступка, практически лишившего его должности в ФБР, Билл объединяется с Гари для поиска похищенной дочери богатого и влиятельного бизнесмена. Несмотря на недовольство Бюро Билла присоединяют к расследованию, однако вскоре неудачно сложившиеся обстоятельства изменяют ситуацию. Тем временем между Ниной и Кэмероном зарождаются отношения, Харкен пересматривает свои желания, а команда Альфа присоединяется к заданию Билла и вычисляет шпиона, затесавшегося в близкое окружение безутешного отца.

После взрыва в квартире давней знакомой доктора Розена альфы Скайлер Адамс, ФБР, полагая, что ей необходима помощь, посылает команду Ли разыскать девушку и обеспечить ее безопасность. Группе удается спасти ее от неизвестных преступников, только вот Адамс не горит желанием сотрудничать, а злоумышленники вскоре обнаруживают штаб команды. Между тем Гари вступает в противостояние с матерью, не позволяющей ему продолжать работу в команде, Билл достает сведения о секретной деятельности Скайлер, наводящей на подозрения о ее связи с группировкой «Красный флаг», а Нина вступает на опасный путь ради помощи старой знакомой.

Розен вынужден использовать свои хитрость и дар убеждения, чтобы противостоять могущественному альфа, считающем себя посланником господа и использующим свой дар для превращения людей в безвольную паству. Когда вслед за Хиксом воздействию «божественной силы» подвергается Теру с Харкеном, а ставшие прихожанами люди начинают умирать, оказавшийся в заточении Ли добывает противоядие, однако узнав о побочном эффекте лекарства альфа-пастырь решается на последний шаг в приближении к раю. Тем временем Рэйчел ждет печальная новость об одном из членов ее семьи.

Члены команды захватывают врача, не только являющегося одним из людей со сверхспособностями, но и работающего над заселением земли похожими на него неординарными людьми. В то время как доктор Розен пытается выпытать у плененного мужчины его планы и мотивы, остальные члены команды начинают замечать в офисе необъяснимые странности, а после бесследной пропажи одного из членов команды Ли приходится решить, кто является наиболее опасным противником — безобидный на первый взгляд ученый или невидимый похититель, планомерно отрезающий команде пути к отступлению.

Доктор Розен и его команда оказываются в тюрьме для сверходаренных преступников после того, как ФБР начинает подозревать в одном из них предателя, слившего информацию о ведущих работниках глобальной альфа-программы, каждого из которых вскоре после этого убили весьма странным способом. Нэйтан Клэй проводит допрос членов группы, в ходе которого выясняется о личных разговорах Гари с работающей на «Красный флаг» Анной. Между тем Клэй ставит команде условие — самостоятельно найти в своих рядах предателя, иначе их всех ждет место, из которого альфа не возвращаются.

В попытках выследить таинственного убийцу работников альфа-программы, Ли узнает, что злоумышленник на сей раз преследует его дочь, Даниэль. Ожерелье, которое та украла у незнакомца, оказалось ценнее, чем она думала, что подвергло опасности жизнь не только девушки, но и ее окружения. Между тем Гари через Анну узнает о Стэнтоне Пэрише — самом старом и могущественном человеке со способностями, чей манифест и стал доктриной движения «Красный флаг». Раскрыв местоположение встречи Пэриша с членами движения, ФБР устраивает засаду, однако развивающиеся события ставят под сомнение правильность совершенного нападения на экстремистов и сокрытия информации о людях-альфа.